位于繁華都市的海征醫(yī)院年輕軍醫(yī)方子心、李亦濤等磨煉多年已是醫(yī)學骨干，和平方舟軍醫(yī)董劍如接到上級命令負責選拔軍醫(yī)人才，方子心等面對突如其來的人生抉擇，內(nèi)心和現(xiàn)實產(chǎn)生劇烈沖突，在方宇帆等老中青三代人為中國醫(yī)療救護事業(yè)自我犧牲的精神感召下，毅然投入苛刻的層層選拔并脫穎而出。他們出遠海實習突遇海上緊急病情求援，意外陷入病毒威脅，面臨生死考驗，他們堅守醫(yī)者仁心，以精湛醫(yī)術征服海盜并成功搗毀某海島國際恐怖基地。在和平方舟上，他們利用醫(yī)學知識培養(yǎng)的病毒抗體拯救了島上所有感染者。他們“救死扶傷，大醫(yī)至善”，維護世界和平，最終成為光榮的和平方舟軍醫(yī)。